В Алтайском заповеднике проводятся мероприятия, направленные на профилактику и тушение лесных пожаров. Отдел охраны заповедника на данный момент уже принял участие в ликвидации одного пожара в прилегающей к заповеднику территории. Однако главной задачей остаётся предотвращение пожаров. Принимаются все необходимые меры по обеспечению пожарной безопасности в заповеднике и на прилегающей к нему территории.
В апреле 2012 года, в рамках соглашения, заключённого между ФГБУ «Алтайский государственный заповедник» и Министерством лесного хозяйства Республики Алтай на возникший в прилегающей к заповеднику территории пожар была отправлена группа пожаротушения (5 госинспекторов), обеспеченная необходимыми средствами пожаротушения.
Совместно с группой пожаротушения АУРА (автономного учреждения Республики Алтай) «Байгол Лес» группа госинспекторов заповедника 12 апреля 2012 года на вертолете Ми-8 была высажена на пожар вблизи границы Алтайского заповедника. Задача группы пожаротушения состояла в ликвидации пожара и недопущения распространения его на территорию заповедника. С поставленной задачей группа пожаротушения справилась и возвратилась с ликвидированного пожара 18 апреля 2012 года.
Постоянно проводится разъяснительная работа с населением - с жителями кордонов заповедника и пос. Яйлю по наведению порядка на приусадебных участках и требований пожарной безопасности в лесах.
Клубы друзей Алтайского заповедника активно включаются в просветительскую работу по противопожарной тематике. Проводятся профилактические беседы и раздаются листовки противопожарной тематики в пос. Яйлю, пос. Беле, с. Балыкча. Переданы такие же просветительские материалы детским клубам в с. Улаган, Язула.
17 апреля 2012 года в с. Балыкча Улаганского района клубом друзей Алтайского заповедника «Дневной дозор» проведён форум «Огонь – друг и враг», в котором приняли участие дети трёх поколений – это лидеры экологического движения Кошева Мария, Чоков Денис, юные экологи - семиклассники и старшие дошкольники детсада «Аючак» с руководителем Тойдоновой Еленой. В Яйлинской основной школе Турочакского района на днях проведена линейка, посвящённая противопожарной безопасности.