Образован 16 апреля 1932 года
Объект Всемирного природного наследия ЮНЕСКО (с 1998 года)
Включён во Всемирную сеть биосферных резерватов Программы ЮНЕСКО «Человек и биосфера» (МАБ) - 26 мая 2009 года
Входит в список «Global-200» - девственных или мало изменённых экорегионов мира, в которых сосредоточено 90% биоразнообразия планеты
В связи с установившейся жаркой погодой, усилением ветра в Республике Алтай, с целью обеспечения пожарной безопасности на территории Алтайского заповедника и своевременного обнаружения природных пожаров, приказом по заповеднику введён особый режим охраны до 30 апреля 2022 года.
В соответствии с режимом усиленной охраны: