Образован 16 апреля 1932 года
Объект Всемирного природного наследия ЮНЕСКО (с 1998 года)
Включён во Всемирную сеть биосферных резерватов Программы ЮНЕСКО «Человек и биосфера» (МАБ) - 26 мая 2009 года
Входит в список «Global-200» - девственных или мало изменённых экорегионов мира, в которых сосредоточено 90% биоразнообразия планеты
В октябре 2022 года сотрудниками Алтайского заповедника было принято решение о поддержке Специальной военной операции по демилитаризации и денацификации на Украине в виде добровольных взносов на приобретение материальных ресурсов.
Общая сумма взносов за 2022 год составила 63443,41 руб. Для обеспечения эффективного расходования средств и приобретения требуемых ресурсов была проведена встреча старшего госинспектора заповедника с руководством Росгвардии РА. Результатом стало определение перечня необходимого оборудования, которое и решено приобрести на собранные средства.